物质中能独立存在而保持其组成和一切化学特性的最小微粒。分子可以由1个原子组成，如He、Ar、Xe；也可以由一种元素的几个原子组成，如O2、O3、S8、N2、H2，这些原子以共价键结合而成单质分子。大多数的分子是由几种不同元素的原子组成的，如 H2O、CO2、CH4、C2H5OH，它们分别表示水分子、二氧化碳分子、甲烷分子、乙醇分子的组成。H2O分子是保持水的组成和特性的最小微粒，若再分解，就成了H2和O2，这就失去了水的特性。
随着现代化学键理论的发展，人们认识到自由基和准分子（即基态时不稳定，但激发态时稳定的分子，见不稳定分子）也都可以称为分子。
