政府公投公司运作从政府投融资平台的产生过程，主要存在公用基础设施建设、政策性产业扶持基金、农业产业投资公司三种运行模式。
（一）公用基础设施建设融资模式
是指政府通过契约授予私营企业（包括外国企业）以一定期限的特许专营权，许可其融资建设和经营特定的公用基础设施，并准许其通过向用户收取费用或出售产品以清偿贷款，回收投资并赚取利润；特许权期限届满时，基础设施无偿移交给政府。
（二）政策性产业扶持基金融资模式
1、创业投资引导基金。
2.贷款风险补偿基金。
（三）农业产业投资公司融资模式及评价
在农业产业投资方面，政府融资平台的运行借鉴了其他产业投资公司的融资模式。就现阶段而言，政府农业产业投资公司主要以农业担保公司为主，在政府对农业产业的财政支持上仍然以农业补贴、贷款贴息等方式为主。
