张角，张宝，张梁，三兄弟张宝最后被打倒。对分散在各地的黄巾军，东汉王朝采取各个击破的战略。
中平元年三月，汉灵帝发天下精兵，命北中郎将卢植率军进攻张角，左中郎将皇甫嵩、右中郎将朱俊率军进攻颍川波才黄巾。
波才打败了朱俊军，并在长社把皇甫嵩军围住，皇甫嵩兵少，军中皆恐。但波才缺乏战斗经验，依草结营，被汉军用火攻打败。退至阳翟时又被朱俊军、皇甫嵩军与曹操带来的援军打败。汉军接着向东进攻，击败了汝南、陈国黄巾以及东郡黄巾，卜已被俘。
南阳黄巾也被击败，张曼成、赵弘、韩忠先后战死。钜鹿黄巾是黄巾军的主力，东汉王朝先后派卢植和董卓进攻张角。张角坚守广宗（今河北威县）。
中平元年八月，东汉以皇甫嵩代董卓进攻钜鹿黄巾。那时张角已病死，起义军由张梁统率。十月，汉军偷袭张梁军营，张梁阵亡；汉军又攻张宝于下曲阳（今河北晋县），张宝败死，钜鹿黄巾全军覆没。
东汉末年政局不稳，外戚专政，宦官专权，对西羌战争持续数十年，花费巨大，徭役兵役繁重。加之土地兼并现象严重，民不聊生。加之古代社会，人民皆有宗教信仰，张角、张宝、张梁三兄弟趁此机会，救助人民，又大力宣传“苍天已死，黄天当立，岁在甲子，天下大吉”。
三兄弟得到了很多人民的拥护，而当时朝廷，人民则早已失去了信任。在这种情况下，三兄弟创立太平道，以宗教的方式笼络人心，在贫苦农民中树立了威望，信众多达数十万。意图推翻汉朝，并建立由黄巾军统治的的新天下。黄巾起义对于东汉末年的政局产生了深远的影响。
为了尽快平定战事，中央下放军权至地方，使得黄巾起义的浪潮无法快速蔓延至全国，减缓了东汉覆亡的危机。但是却造成了地方轻视中央，使得具有野心的将领或官员借着在镇压黄巾起义的过程中拥有兵力割据地方，为东汉末年军阀混战揭开了序幕，更为三国分立种下远因。在农民起义的打击下，腐朽的东汉王朝名存实亡，并最终走向了灭亡。
