高倍镜和低倍镜的区别在于：高倍镜物镜与装片的距离较近；所看到的细胞数目少形态大；视野相对较暗；清晰度比低倍镜高。
低倍镜的物镜与装片的距离较远；所看到细胞数目多形态小；视野相对较明；清晰度相对较低。
使用高倍物镜之前，必须先用低倍物镜找到观察的对象，并调到视野的正中央，然后转动转换器再换高倍物镜。换用高倍物镜后，视野内亮度变暗，因此一般用较大的光圈并使用反光镜的凹面，然后调节细准焦螺旋。观看的物体数目变少，体积变大。
显微镜的倍数是相对而言的，一般显微镜,转换的是物镜，目镜一般不变，所以用10倍物镜如果是低倍则40倍物镜就是高倍，没有明确的界限，低倍镜倍数小，看到的细胞数目多，高倍镜倍数大，看到的细胞数目多，但视野较暗。
